Cloudflare を経由していないサイトの場合の設定方法です。
Cloudflare Web Analytics にサイトを追加
Cloudflare Dashboard で、 Analytics > Web Analytics と進みます。

Add a site をクリックします。

ホスト名を入力し、Done をクリックします。

Cloudflare を経由していないサイトの場合、登録後に JavaScript snippet が表示されるのでコピーします。
このスニペットを、通常は
の直前などに入れます。